IL-1RA ve IL-4 gen fonksiyonel VNTR varyantlarının oral skuamöz hücreli karsinoma etkisiOzge Gumusay1, Ayse Feyda Nursal2, Serbulent Yigit3, Akin Tekcan4, Tuba Oz31Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı, Tokat, Türkiye
2Hitit Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Genetik Anabilim Dalı, Çorum, Türkiye
3Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Tokat, Türkiye
4Ahi Evran Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Kırşehir, Türkiye
GİRİŞ ve AMAÇ: Konakçı immun cevabının ve kronik enflamasyonun kanser için önemli risk faktörleri olarak rol oynadığı gösterilmiştir. Oral skuamöz hücreli kanser (OSHK) tüm dünyada yaygın bir kanser türüdür. Bu çalışmada Türk toplumunda IL-1RA ve IL-4 değişken sayılı ardışık tekrar (VNTR) polimorfizminin OSHK yatkınlığına olan etkisini incelemeyi amaçladık.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışma grubu 36 OSHK hastası ve 100 sağlıklı kontrolden oluşmaktadır. IL-1RA VNTR (rs2234663) ve IL-4 VNTR (rs79071878) polimorfizmlerinin genotiplemesi PCR ile analiz edildi.
BULGULAR: IL-1RA VNTR 1/1 genotipi kontrol grubunda hastalardan daha fazla iken IL-1RA VNTR 1/2+ 2/2 genotipleri hastalarda sağlıklı kontrollere göre artmıştı (p=0,002). IL-1RA VNTR 1/2+2/2 genotiplerini taşıyan kişiler OSHK'e yatkınlık yönünden 12,011 kat fazla risk gösterdiler. IL-1RA VNTR allel 2 hasta grubunda kontrol grubundan daha fazla iken IL-1RA VNTR allel 1 kontrol grubunda hasta grubundan daha fazlaydı (sırasıyla, p=0,000, p=0,000). IL-1RA VNTR allel 2 taşıyan kişiler OSHK'e yatkınlık yönünden 2,609 kat fazla risk gösterdiler. IL-4 VNTR P1/P1 ve P1/P2 genotip sıklığı hasta grubunda kontrol grubuna göre daha fazlaydı (p=0,039). IL-4 VNTR P1 alleli hastalarda kontrollere göre daha yüksekti (p=0,030).
TARTIŞMA ve SONUÇ: Türk popülasyonunda IL-1RA/IL-4 VNTR polimorfizmleri ve OSHK yatkınlığı arasındaki önemli ilişki OSHK etyopatogenezinde değişen enflamatuar işlevlerin rolü olduğunu doğrulamıştır.
Anahtar Kelimeler: Oral skuamöz hücreli karsinom, IL-1RA, IL-4, VNTR, polimorfizm.
Impact of the functional VNTR variants of the IL-1RA and IL-4 genes on oral squamous cell carcinomaOzge Gumusay1, Ayse Feyda Nursal2, Serbulent Yigit3, Akin Tekcan4, Tuba Oz31Gaziosmanpasa University, Faculty of Medicine, Department of Medical Oncology, Tokat, Turkey.
2Hitit University, Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics, Corum, Turkey.
3Gaziosmanpasa University, Faculty of Medicine, Department of Medical Biology, Tokat, Turkey.
4Ahi Evran University, Faculty of Medicine, Department of Medical Biology, Kirsehir, Turkey.
INTRODUCTION: It has been shown that the host immune response and chronic inflammation could play a role as important risk factors for cancer. Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is a common cancer worldwide. In this study, we aimed to evaluate the impact of IL-1RA and IL-4 variable number tandem repeat (VNTR) polymorphisms on OSCC susceptibility in a Turkish population.
METHODS: Study subjects comprised 36 OSCC patients and 100 healthy controls. Genotyping of the IL-1RA VNTR (rs2234663), and IL-4 VNTR (rs79071878) polymorphisms were analysed by PCR.
RESULTS: The frequency of IL-1RA VNTR 1/2+2/2 genotypes increased in the patients than healthy controls while IL-1RA VNTR 1/1 genotype was higher in the control group than in the patients (p=0.002). The subjects carrying IL-1RA VNTR 1/2+2/2 genotypes showed a 12.011 -fold increased risk of susceptibility to OSCC. IL-1RA VNTR allele 1 was higher in the control group than the patient group while IL-1RA VNTR allele 2 was higher in the patient group than the control group (respectively, p=0.000, p=0.000). The subjects carrying IL-1RA VNTR allele 2 showed a 2.609-fold increased risk of susceptibility to OSCC. The IL-4 VNTR P1/P1 and P1/P2 genotype frequency were higher in the patient group compared to the control group (p=0.039). IL-4 VNTR P1 allele was higher in the patients compared to the controls (p=0.030). ).
DISCUSSION AND CONCLUSION: The significant association between functional VNTR polymorphisms of IL-1RA/ IL-4 genes and OSCC suspectibility in a Turkish population confirmed a role for altered inflammatory process in OSCC pathogenesis.
Keywords: Oral squamous cell carcinoma, IL-1RA, IL-4, VNTR, polymorphism.
Sorumlu Yazar: Ayse Feyda Nursal, Türkiye
|
|
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder
PubMed