COVID-19 Pandemisinde Bir Mikrobiyoloji Laboratuvarı İş Akışı: Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Deneyimiİsmail Davarcı, Şaban Gürcan, Berrak KaplanTrakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Edirne
GİRİŞ ve AMAÇ: COVID-19 salgını ilk olarak Çin’de başlamış olup tüm dünyaya yayılmıştır. Ülkemizde salgın yönetimi Sağlık Bakanlığı koordinesinde yapılmaktadır. İlimizdeki vaka artış hızının aylar içinde değişmesiyle birlikte hastanemizde oluşan ihtiyaçlara Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı olarak eksiksiz cevap verilmiştir. Bu çalışmada bu deneyimlerimizi aktarmak ve pandeminin ilk yedi ayında Coronavirus Laboratuvarı’na gelen örneklerin retrospektif analizini yapmak amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Pandemi sürecinde güvenli bir çalışma ortamı oluşturmak ve iş akışını organize etmek için laboratuvar içinde bir takım değişiklikler yapılıp rehber haline getirilmiştir. Ayrıca 21.03.2020-21.10.2020 tarihleri arasında Coronavirus Laboratuvarı’na gelen SARS-CoV-2 PCR ve anti-SAR-CoV-2 antikor testleri retrospektif olarak taranmıştır.
BULGULAR: : Laboratuvarımızda toplam 73773 SARS-CoV-2 PCR testi, 1170 anti SARS-CoV-2 antikor testi çalışılmıştır. Toplam PCR pozitifliğinin %2,7, antikor pozitifliğinin ise %1,9 olduğu tespit edilmiştir.
TARTIŞMA ve SONUÇ: PCR pozitiflik oranları incelendiğinde alınan önlemler ile ilk aydan sonra dramatik bir düşük gözlenmekte ve bu düşüş beşinci aya kadar devam etmektedir. Önlemlerin gevşetilmesi ile altıncı ve yedinci aylarda PCR pozitifliğinin tekrar yükseldiği görülmektedir. Pandeminin ilk aylarında elde ettiğimiz deneyimlerimizin diğer laboratuvarlar için değerli bilgiler sağlayabileceğini düşünülmektedir.
Anahtar Kelimeler: COVID-19, pandemi, mikrobiyoloji, laboratuvar
A Microbiology Laboratory Workflow in the COVID-19 Pandemic: Trakya University Medical Faculty Experienceİsmail Davarcı, Şaban Gürcan, Berrak KaplanDepartment Of Medical Microbiology, Trakya University, Edirne, Turkey
INTRODUCTION: The COVID-19 epidemic first started in China and spread all over the world. In our country, epidemic management is carried out under the coordination of the Ministry of Health. With the change in the case increase rate in our province within months, the needs of our hospital were fully answered as the Medical Microbiology Laboratory. In this study, it is aimed to convey our experiences and to make a retrospective analysis of the samples that came to the Coronavirus Laboratory in the first seven months of the pandemic.
METHODS: In order to create a safe working environment and organize the work flow during the pandemic process, some changes have been made in the laboratory and it has been made a guide. In addition, SARS-CoV-2 PCR and anti-SAR-CoV-2 antibody tests that came to the Coronavirus Laboratory between 21.03.2020-21.10.2020 were screened retrospectively.
RESULTS: A total of 73773 SARS-CoV-2 PCR tests and 1170 anti-SARS-CoV-2 antibody tests were run in our laboratory. It was determined that total PCR positivity was 2.7% and antibody positivity was 1.9%.
DISCUSSION AND CONCLUSION: When the PCR positivity rates are examined, a dramatic decrease is observed after the first month with the measures taken and this decrease continues until the fifth month. It is seen that PCR positivity increased again in the sixth and seventh months with the relaxation of the measures. It is thought that our experiences in the first months of the pandemic can provide valuable information for other laboratories.
Keywords: COVID-19, pandemic, microbiology, laboratory
Sorumlu Yazar: İsmail Davarcı, Türkiye
|
|
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder
PubMed