Yaygın-Dirençli Acinetobacter baumannii İzolatlarının Pulsed Field Jel Elektroforezi Yöntemi ile GenotiplendirilmesiBusra Pekince1, Nurullah Ciftci1, DUYGU FINDIK1, Fatma Kalem2, Şerife Yüksekkya3, Tuba Seyhan1, Hatice Türk Dağı1, UGUR ARSLAN11Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Konya
2Konya Numune Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, Konya, Türkiye
3Konya Meram Devlet Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, Konya, Türkiye
GİRİŞ ve AMAÇ: Acinetobacter baumannii özellikle yoğun bakım ünitelerinde ve immün sistemi baskılanmış hastalarda ciddi hastane enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Bu çalışmanın amacı klinik örneklerinden izole edilen Extrem dirençli/ Yaygın-dirençli A. baumannii suşlarında antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi ve suşlar arasındaki klonal ilişkinin araştırılmasıdır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Çalışmamıza çeşitli klinik örneklerden soyutlanan tigesiklin ve kolistin duyarlı, diğer antibiyotiklere dirençli A. baumannii izolatları dahil edildi. A. baumannii suşlarında ilaç direnç genleri PCR yöntemi ile araştırıldı ve izolatlar arasındaki klonal ilişki PFGE yöntemi ile belirlendi.
BULGULAR: Çalışmamıza 70 A. baumannii izolatı dahil edildi. İzolatların 29'u sadece kolistine, ikisi sadece tigesikline ve 39'u kolistine ve tigesikline duyarlıydı. A. baumannii izolatının tamamında blaOXA-51-like geni ve %97,1’inde blaOXA-23-like geni tespit edildi. Diğer OXA tiplerinden blaOXA-24-like, blaOXA-48-like, blaOXA-58-like ve blaOXA-143-like genleri saptanmadı. Karbapenemaz aktivitesini gösteren blaISAba-like geni üç örnekte (%4,2) pozitif olarak bulundu. blaVIM-like, blaIMP-like, blaNDM-1-like, blaSPM-1-like, blaKPC-like ve blaGES-like genleri ise hiçbir suşta saptanmadı. A. baumannii izolatlarının DNA’sına yapılan PFGE yöntem ile 27 grup belirlendi. Dendogramda izolatların özellikle üç grupta (7,10 ve 21) yoğunlaştığı görüldü.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Bu çalışmada, blaOXA-51-like ve blaOXA-23-like gen bölgelerinin, A. baumannii’de yaygın ilaç direncinde önemli rol oynadığı görüldü. İzolatlarımızda OXA-51-like ve OXA-23-like’ün yüksek oranda tespit edilip diğer OXA tiplerinin ve metallo-𝛽-laktamaz genlerinin tespit edilmemesi izolatlardaki yaygın ilaç direncinden bu iki tipin sinerjitik etki göstermesinin veya enzimatik mekanizmalarla beraber dış membran proteinleri ve atım pompa sistemlerinin sorumlu olabileceğini düşündürdü. Yaptığımız klonal çalışmada ise yaygın ilaç dirençli A. baumannii suşlarının bazı kliniklerde baskın suş olduğu ve aynı izolatların başka kliniklerde yayılmasının servisler arası transfer edilen hastalar ve çapraz bulaşlar sonucu olduğu kanısına varıldı.
Anahtar Kelimeler: Polimeraz Zincir Rekasiyonu, Pulsed Field Jel Elektroforez, Yaygın dirençli A. baumannii
Genotyping of Extrem-resistant Acinetobacter baumannii Strains by Pulsed Field Gel ElectrophoresisBusra Pekince1, Nurullah Ciftci1, DUYGU FINDIK1, Fatma Kalem2, Şerife Yüksekkya3, Tuba Seyhan1, Hatice Türk Dağı1, UGUR ARSLAN11Department of Medical Microbiology, Selcuk University, Konya, Turkey
2Konya Numune Hospital, Medical Microbiology, Konya, Turkey
3Konya State Hospital, Medical Microbiology, Konya, Turkey
INTRODUCTION: Acinetobacter baumannii may lead serious nosocomial infections, especially in intensive care units and immunocompromised patients. The aim of this study was to determine antibiotic resistance genes in Extreme resistant/Common-resistant A. baumannii strains isolated from clinical specimens and investigate clonal relationship between strains.
METHODS: Acinetobacter baumannii strains susceptible to tigecycline/colistin, but resistant to other antibiotics were included in the study. Resistance genes were investigated by PCR test and clonal relationship between isolates was determined by PFGE method.
RESULTS: 70 A.baumannii isolates were included in our study. 29 were susceptible to colistin, two were susceptible to tigecycline and 39 were susceptible to colistin and tigecycline. All strains were positive for blaOXA-51-like gene and 97.1% were positive for blaOXA-23 like gene. Other OXA genes(blaOXA-24-like,blaOXA-48-like,blaOXA-58 like and blaOXA-143-like) were not detected. blaISAba-like was detected positive in three samples(4.2%). blaVIM-like,blaIMP-like,blaNDM-1-like,blaSPM-1-like,blaKPC-like and blaGES-like genes were not detected in any strains. 27 groups were determined by PFGE method. Dendogram analyse showed the isolates were located mainly in three groups (7,10 and 21).
DISCUSSION AND CONCLUSION: This study shows blaOXA-51-like and blaOXA-23-like genes have an important role on XDR of A. baumannii. High level of blaOXA-51-like and blaOXA-23-like genes were detected in the study and other OXA types and metallo-β-lactamase genes were not detected. we believe extreme drug resistance can be due to the synergistic effects of these two types, or enzymatic mechanism of external membrane proteins and efflux pump systems. A. baumannii strains (XDR) were dominant in some clinics and the spread to other clinics was the result of cross-contamination between clinics.
Keywords: Extrem-resistant Acinetobacter baumannii, Protein Chain Reaction, Pulsed Field Gel Electophoresis
Sorumlu Yazar: Nurullah Ciftci, Türkiye
|
|
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder
PubMed