Klebsiella pneumoniae Suşlarında Kolistin Direncinin Saptanmasında Otomatize Sistemlerin Sıvı Mikrodilüsyon ile KarşılaştırılmasıBurak Ezer1, Zekeriya Taşkın1, Kadir Kaba2, Selin Ugrakli1, Metin Doğan11Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji, Konya
2Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya, Konya
GİRİŞ ve AMAÇ: Çoklu ilaç direncine sahip K.pneumoniae suşlarında kolistin direncinin saptanmasında otomatize sistemler altın standart yöntem olan sıvı mikrodilüsyon yöntemine göre hatalı sonuçlar vermektedir. Otomatize sistemlerin kolistin direncini doğru saptamasıyla ilgili kıyaslama yapılan çalışmalar literatürde kısıtlıdır. Bu çalışmanın amacı; üç yıllık dönemde çeşitli klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin duyarlılıkların belirlenmesinde sıvı mikrodilüsyon yöntemi referans alınarak Vitek2 Compact otomatize sistemi ve Phoenix otomatize sisteminin duyarlılık sonuçlarının karşılaştırılmasıdır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: K.pneumoniae suşlarının tanımlanması konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve otomatize bakteri tanımlama sistemi Vitek2 (bioMérieux, MarcyL’Etoile, Fransa) ve Phoenix otomatize sistem (Bectondickinson, M50, ABD) kullanılarak yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri de yine aynı cihazlarla yapılmıştır. Kolistin duyarlığı ise hem otomatize yöntemlerle hem de sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile eş zamanlı olarak belirlenmiştir.
BULGULAR: Çalışmamızda; Vitek2 otomatize sistem için Kategorik Uyum (KU) oranı %93,71, Çok Büyük Hata (ÇBH) oranı %6,89, Büyük Hata (BH) oranı ise %1,41 tespit edilmiştir. Phoenix otomatize sistem için ise KU oranı %95,05, ÇBH oranı %3,44, BH oranı ise %1,50 olarak tespit edilmiştir. Vitek2 için; özgüllük %86,10, lambda değeri ise 0,82, kappa değeri 0,83 olarak tespit edilmiştir. Phoenix için ise; özgüllük %88,20, lambda değeri ise 0,82, kappa değeri 0,87 olarak tespit edilmiştir.
TARTIŞMA ve SONUÇ: K.pneumoniae için kolistin duyarlılığının saptanmasında Phoenix otomatize sisteminin Vitek2 otomatize sisteme göre üstünlüğü bu çalışmada üstün bulunmuştur.
Anahtar Kelimeler: Vitek2, Phoenix, kolistin, direnç
Comparison of Automated Systems using Liquid Microdilution for the Determination of Colistin Resistance in Klebsiella pneumoniae StrainsBurak Ezer1, Zekeriya Taşkın1, Kadir Kaba2, Selin Ugrakli1, Metin Doğan11Necmettin Erbakan University Meram Faculty of Medicine, Medical Microbiology, Konya
2Necmettin Erbakan University Meram Faculty of Medicine, Medical Biochemistry, Konya
INTRODUCTION: In the detection of colistin resistance in K.pneumoniae strains with multidrug resistance,
automated systems give more erroneous results than the gold standard method, the liquid
microdilution method. Comparative studies on the correct detection of colistin resistance by
automated systems are limited in the literature. In this study; it is aimed to compare Vitek2
Compact and Phoenix automated systems by using liquid microdilution method in the
determination of colistin susceptibility in K.pneumoniae strains isolated from various clinical
specimens over a three-year period.
METHODS: Identification of Klebsiella pneumoniae strains was performed using conventional
microbiological methods and automated bacterial identification systems which are Vitek2
(bioMérieux, MarcyL’Etoile, France) and Phoenix (Becton dickinson, M50, USA). Antibiotic susceptibility tests were also performed with the same devices. Colistin sensitivity was determined simultaneously with both automated methods and liquid microdilution method.
RESULTS: In our study, for the Vitek2 automated system, the Categorical Agreement (CA) ratio is
93.71%, the Very Major Error (VME) rate is 6.89%, and the Minor Error (ME) rate is 1.41%.
For the Phoenix automated system, the CA ratio is 95.05%, the VME rate is 3.44%, and the
ME rate is 1.51%.Vitek2; specificity is 86.10%, lambda value is 0.82, and kappa value is
0.83. For the Phoenix system, specificity is 88.20%, lambda value is 0.82, and kappa value
is 0.87.
DISCUSSION AND CONCLUSION: The superiority of the Phoenix automated system over the Vitek2 automated system in
detecting colistin susceptibility for K. pneumoniae was found to be superior in this study.
Keywords: Vitek2, Phoenix, colistin, resistance
Sorumlu Yazar: Burak Ezer, Türkiye
|
|
Yazdır
Alıntıyı İndir
RIS
E-Postala
Paylaş
Yazara e-posta gönder
PubMed